O Ιοάν Αντόνε ανέλαβε την ομάδα μετά την αποχώρηση του Χένκ Χάουαρντ ο οποίος ανέλαβε την Ομόνοια που βρισκόταν εν μέσω κρίσης τον (ξανα)κάλεσε και ο τότε 60χρονος Χάουαρντ δεν είπε «όχι», αφού όπως κι ο ίδιος παραδέχτηκε, «δέθηκα μ’ αυτήν την ομάδα και την αγάπησα». Μετά όμως από κάποια ατυχή αποτελέσματα ο Χάουαρντ αποδεσμεύτηκε στην 14η αγωνιστική και τη θέση του πήρε ο 46χρονος τότε Ιοάν Αντόνε, ο οποίος υπήρξε διεθνής στα νιάτα του και όταν σταμάτησε το ποδόσφαιρο έγινε προπονητής. Έκανε «όνομα» στην πατρίδα του βρισκόμενος στον πάγκο της Διναμό Bουκουρεστίου στην οποία ήλθε σε σύγκρουση με τον πρόεδρο κι έφυγε για να έλθει στην Kύπρο και στην Oμόνοια τον Δεκέμβρη του 2005.
Ο Αντόνε προσπάθησε να αλλάξει τη φιλοσοφία του παιχνιδιού της ομάδας, εν μέρει όμως τα κατάφερε γι΄ αυτό και δεν στεύθηκε με επιτυχία η χρονιά. Στη δεύτερη χρονιά, όταν ξεκίνησε στον πάγκο της ομάδας από την αρχή άντεξε 15 αγωνιστικές και αποδεσμεύτηκε την 15η για να προσληφθεί ο Γιάννης Ματζουράκης. Στις δύο χρονιές που κάθισε στον πάγκο της Ομόνοιας η ομάδα τερμάτισε 2η και τις δύο χρονιές την πρώτη πίσω από τον Απόλλωνα και τη δεύτερη πίσω από το ΑΠΟΕΛ.