Ιδιαίτερη έμφαση δίνει το σωματείο μας στην ανάπτυξη της ακαδημίας ποδοσφαίρου, στην οποία ήδη εφαρμόζεται πλάνο αναδιοργάνωσης, που στόχο έχει να δημιουργήσει τις υποδομές και συνθήκες ώστε, σε βάθος χρόνου, να τροφοδοτείται η πρώτη ομάδα με νεαρούς ποδοσφαιριστές, που θ' αναδεικνύονται μέσα από τα «σπλάχνα» της ΟΜΟΝΟΙΑΣ.
Την αγωνιστική περίοδο 2015-16 η Ακαδημία Ποδοσφαίρου Ομόνοιας έχει εγγεγραμμένα 543 παιδιά και εργοδοτεί συνολικά 34 προπονητές, ενώ διαθέτει ομάδες στις πιο κάτω ηλικιακές κατηγορίες:
Κ21
Κ17
Κ16
Κ15
Κ13 Λευκωσίας (1 και 2)
Κ13 Λάρνακας
Κ13 Λεμεσού
Grassroots - 22 ομάδες (11 ομάδες στη Λευκωσία, 7 ομάδες στη Λάρνακα και 4 ομάδες στη Λεμεσό).
Για τις ανάγκες προπονήσεων και αγώνων της ακαδημίας χρησιμοποιούνται οι πιο κάτω αθλητικές εγκαταστάσεις:
προπονητικό κέντρο Ηλίας Πούλλος
γήπεδο ΑΟΛ Λακατάμειας
κοινοτικό γήπεδο Κοκκινοτριμιθιάς
γήπεδα ΑΣΠΙΣ Ποταμιάς
γήπεδο ΑΣΠΙΣ Γερίου
γήπεδο Ορφέα Λευκωσίας
γήπεδο Αναγέννησης Λυθροδόντα
βοηθητικό γήπεδο Μακαρείου σταδίου
γήπεδα LFC Λειβάδια
γήπεδο ΑΣΠΙΣ Πύλας
γήπεδο Ερμή Πολεμιδιών
γήπεδα Καρανικόλα
Επίσης η ακαδημία χρησιμοποιεί μέρος των αθλητικών εγκαταστάσεων της πρώτης ομάδας (π.χ. γυμναστήριο, φυσιοθεραπευτήριο).
Ιδιαίτερα σημαντική κρίνεται η συμφωνία που έχει συνάψει η ακαδημία με το Αθλητικό Τμήμα της Ιδιωτικής Σχολής ΠΑΣΚΑΛ.
Πραγματοποιούνται σε τακτά χρονικά διαστήματα επιστημονικές μετρήσεις, σε συνεργασία με αθλίατρο, εργοφυσιολόγο, ποδολόγο και γυμναστές.
Ακόμη, διεξάγονται προγραμματισμένα σεμινάρια, σε συνεργασία με αθλητικό ψυχολόγο και διατροφολόγο.
Το τελευταίο χρονικό διάστημα, η ακαδημία συμμετείχε στα ακόλουθα διεθνή τουρνουά, υψηλού επιπέδου:
- Αρχικά η ομάδα των Κ19 έδωσε το παρών της στο τουρνουά Karel Stegeman στο Ρούουρλο της Ολλανδίας.
- Ακολούθως οι γεννηθέντες τα έτη 2003, 2004 και 2005 ποδοσφαιριστές, συμμετείχαν σε τουρνουά που διοργάνωσε η Ακαδημία Aspire στο Κατάρ.
- Έπειτα ομάδα των Κ12 συμμετείχε στο Hannah Stiftungs Cup 2015, που διοργανώθηκε στη Βόνη της Γερμανίας.
Στα πιο πάνω τουρνουά οι ομάδες μας αντιμετώπισαν ομάδες που αγωνίζονται στο κορυφαίο επίπεδο στην Ευρώπη, όπως Γκενγκ Βελγίου, Τβέντε και Τζβόλε Ολλανδίας, Κολωνία, Ανόβερο, Μπόχουμ Γερμανίας και Βικτόρια Πίλζεν Τσεχίας, λαμβάνοντας πολύτιμες εμπειρίες.
Η συμμετοχή σε όλα τα πιο πάνω τουρνουά έγινε μετά από πρόσκληση που έλαβε η ακαδημία μας, μέσω των πολύ καλών σχέσεων που έχει αρχίσει να αναπτύσσει με ακαδημίες ευρωπαϊκών συλλόγων, αλλά και συλλόγων από άλλες χώρες του εξωτερικού, ούτως ώστε να δώσει την ευκαιρία στους ποδοσφαιριστές της να διαγωνίζονται σε υψηλό επίπεδο.
Η προσπάθεια για συμμετοχή ομάδων της ακαδημίας ποδοσφαίρου σε τουρνουά του εξωτερικού θα συνεχιστεί και στο άμεσο μέλλον. Βασική επιδίωξη μέσα από τη συμμετοχή σε διεθνή τουρνουά είναι η απόκτηση εμπειριών από πλευράς των ποδοσφαιριστών και της προπονητικής ομάδας, αλλά και ο άμεσος εκσυγχρονισμός και ανάπτυξη της ακαδημίας.